Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 ABCC6P1-202ENST00000565118 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AC073465.1-201ENST00000456671 464 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AC138781.1-201ENST00000501322 505 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SETXQ7Z333 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms