Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APTXQ7Z2E3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms