Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC149Q6ZUS6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms