Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSTM1Q6UX27 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms