Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC01545Q5VT33 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms