Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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