Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms