Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms