Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MSMPQ1L6U9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms