Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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