Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PTPRNQ16849 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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