Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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