Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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PTPROQ16827 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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