Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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