Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms