Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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NEDD8Q15843 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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