Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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