Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SIX1Q15475 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SIX1Q15475 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SIX1Q15475 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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