Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms