Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms