Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SPIDRQ14159 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SPIDRQ14159 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SPIDRQ14159 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SPIDRQ14159 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SPIDRQ14159 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SPIDRQ14159 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SPIDRQ14159 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIDRQ14159 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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