Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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COL4A6Q14031 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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COL4A6Q14031 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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COL4A6Q14031 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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COL4A6Q14031 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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