Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPSQ13938 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms