Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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ATP1A4Q13733 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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ATP1A4Q13733 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ATP1A4Q13733 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ATP1A4Q13733 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ATP1A4Q13733 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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