Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms