Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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