Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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