Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SKP2Q13309 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SKP2Q13309 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SKP2Q13309 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SKP2Q13309 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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