Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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