Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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