Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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