Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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