Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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CHAF1AQ13111 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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CHAF1AQ13111 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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CHAF1AQ13111 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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CHAF1AQ13111 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CHAF1AQ13111 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CHAF1AQ13111 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CHAF1AQ13111 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CHAF1AQ13111 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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