Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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BNIP3Q12983 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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BNIP3Q12983 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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BNIP3Q12983 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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