Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TRAF2Q12933 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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