Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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