Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CNTN1Q12860 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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CNTN1Q12860 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CNTN1Q12860 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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