Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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NUP160Q12769 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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NUP160Q12769 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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NUP160Q12769 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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NUP160Q12769 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP160Q12769 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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