Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms