Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms