Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms