Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms