Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LTBQ06643 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LTBQ06643 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LTBQ06643 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LTBQ06643 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LTBQ06643 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LTBQ06643 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LTBQ06643 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LTBQ06643 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LTBQ06643 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LTBQ06643 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LTBQ06643 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms