Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms