Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms