Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms