Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms