Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms