Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
OC90Q02509 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
OC90Q02509 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
OC90Q02509 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
OC90Q02509 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
OC90Q02509 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
OC90Q02509 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
OC90Q02509 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
OC90Q02509 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
OC90Q02509 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms