Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XPCQ01831 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XPCQ01831 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XPCQ01831 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XPCQ01831 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XPCQ01831 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XPCQ01831 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XPCQ01831 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XPCQ01831 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
XPCQ01831 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms